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PCR耗材知識大科普,你想了解嗎
發(fā)布日期:2022/11/1 9:54:34
PCR是一種敏感和有效的方法,用于在短時間內(nèi)將單拷貝的目標(biāo)DNA序列擴(kuò)增至數(shù)百萬拷貝。

因此用于PCR反應(yīng)的塑料耗材必須避免存在污染物和抑制劑,同時又具有可保障最佳PCR效果的高質(zhì)量。

01

塑料耗材組成

材料

PCR / qPCR耗材通常由聚丙烯制成,因?yàn)樗嵌栊缘牟⑶夷軌虺惺軣嵫h(huán)過程中溫度的快速變化。聚丙烯的惰性性質(zhì)使其對于反應(yīng)物質(zhì)的吸收降低至最小,確保獲取最佳的PCR結(jié)果。為了進(jìn)一步保障在純度和生物兼容性方面的批次間一致性,應(yīng)當(dāng)在生產(chǎn)過程中使用全新未循環(huán)使用的醫(yī)學(xué)級或分子生物學(xué)級高品質(zhì)聚丙烯原料。請注意,某些PCR / qPCR板邊框用更強(qiáng)的聚碳酸酯框 制成,以與高通量機(jī)器人應(yīng)用兼容。

顏色

PCR管和板通??商峁┒喾N不同的顏色形式,以便于對于樣品的視覺區(qū)分和鑒別,特別是在高通量實(shí)驗(yàn)中。盡管耗材的顏色對DNA擴(kuò)增沒有影響,但在設(shè)置實(shí)時PCR或qPCR 的反應(yīng)時,與透明耗材相比,我們更推薦使用白色耗材,以實(shí)現(xiàn)靈敏和準(zhǔn)確的熒光檢測。

白色耗材通過阻止熒光折射出管(圖2A)來提高qPCR數(shù)據(jù)的靈敏度和一致性。折射被最小化時,更多的信號被反射回檢測器,從而增加信噪比(圖2B)。此外,白色管壁可阻止熒光信號傳遞至PCR儀模塊,避免被吸收或不一致地反射熒光信號,從而使重復(fù)實(shí)驗(yàn)(圖1B)中的差異降至最低。在極少數(shù)情況下,如果熒光探測器由于白色孔的信號反射增強(qiáng)而過飽和,可以使用磨砂孔替代。

02

生產(chǎn)概況

防止灰塵和生物學(xué)污染物

為了避免可干擾DNA擴(kuò)增的污染,PCR/qPCR塑料耗材應(yīng)不含核酸酶和DNA的污染。盡管如高壓和輻射等滅菌方法可去除細(xì)菌和DNA酶,但這些方法并不能去除灰塵和DNA殘留。殘留的灰塵客戶可能會抑制PCR,而片段化的DNA依然可作為模板從而產(chǎn)生非特異性的擴(kuò)增。

因此,在生產(chǎn)這些塑料耗材時,從制模到最終的包裝都必須在具有顆粒數(shù)量限制的設(shè)施環(huán)境中進(jìn)行。例如,100,000級潔凈室允許在立方英尺空氣中不超過100,000個直徑≥0.5μm的顆粒。這些類型的設(shè)施符合國際標(biāo)準(zhǔn)化組織(如ISO 9001 )規(guī)定的嚴(yán)格指導(dǎo)原則,以防止灰塵和生物污染。

質(zhì)量保證檢驗(yàn)

為了確保質(zhì)量,生產(chǎn)商可能需要對PCR/qPCR塑料耗材進(jìn)行視覺或物理檢驗(yàn)其完整性,以確保對于反應(yīng)成分保護(hù)??梢詧?zhí)行物理測試來評估樣品孔的蒸發(fā),密封和電連續(xù)性以檢查泄漏。對于生物測試,塑料耗材會進(jìn)行某些DNA目標(biāo)分子的qPCR擴(kuò)增,以評估核酸酶和人類DNA的污染。生產(chǎn)商對于經(jīng)歷過這些嚴(yán)格檢驗(yàn)的PCR/qPCR塑料耗材可提供相應(yīng)的檢測報告書。

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